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NGS Fast Ligation Module(NGS 快速連接模塊)

英文名稱:NGS Fast Ligation Module

貨 號 :HKM066A

規(guī) 格 :24次/盒

用途:將 DNA adapter 與 3'端添加 dA 的 DNA 文庫片段的快速連接…

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商品詳細
說明書
微生物圖冊
行業(yè)應用
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產品名稱:NGS Fast Ligation Module
中文名稱:NGS 快速連接模塊

產品編號與包裝規(guī)格:

編號產品名稱規(guī)格產品介紹價格
HKM066ANGS Fast Ligation Module24次/盒預混酶模塊(NGS 快速連接)2745

產品描述:

      NGS Fast Ligation module 是專門針對于 illumina 高通量測序平臺所優(yōu)化的預混酶模塊。使用本模塊可以將 3'端 帶有 dA 尾的 DNA 片段與 adapter 進行快速連接。與常規(guī)方法比較,本模塊采用了一步法反應流程,NGS DNA Fragmentation/End Repair/dA-Tailing Module 或 NGS DNA End Repair/dA-Tailing Module 反應后所獲得的片段后 DNA,無需磁珠純化,可使用本模塊直接與 adapter 進行連接,省去了多步磁珠純化步驟,操作更加簡便,文庫轉 化效率更高。
      適用范圍:將 DNA adapter 與 3'端添加 dA 的 DNA 文庫片段的快速連接(如 NGS DNA Fragmentation Module 和 EndRepair/dA-tailing Module 處理后的產物)。
      適用樣本量:1ng -1μg DNA。

產品特點:
      1) 無需磁珠純化,可直接將 DNA adapter 與帶有 dA-Tailing 的 DNA 片段連接;
      2) 連接效率高,可進行微量樣本的 DNA adapter 連接。

注意事項:
      1、開始實驗前,對 DNA 濃度精確定量至關重要,推薦 DNA 上樣量為 1ng-1μg。DNA可溶解于去離子水、10 mM Tris Buffer EB 或 0.1×TE 等。
      2、推薦 DNA 的上樣量指的是片段化后的 dsDNA 的量。推薦 使用 Qubit、Picogreen 或者其他染料法對 DNA 濃度進行精確定 量。
      3、請確認 DNA 溶液中不含陽離子及螯合劑,如果 DNA 溶解 于 1×TE 或不確定 DNA 溶液中的 EDTA 濃度,需先對 DNA 進行純化后再進行片段化反應。

保存條件:-20℃保存,盡量避免反復凍融。

NGS Fast Ligation Module 產品組成:

 A 包裝(24 次)B 包裝(96 次)
Adapter-ligation Enzyme120μl480μl
Adapter-ligation Buffer1ml×21ml×5
RNase Free Water1ml1ml×2

操作步驟:

1,根據經 NGS DNA Fragmentation Module 和 End Repair/dA-Tailing Module 處理后的產物的量,計算使用接頭 的量并按照下表對接頭濃度進行稀釋:

起始樣本量 Adapter稀釋倍數(shù)稀釋后 Adapter
100ng<X≤1μg不稀釋10μM
25ng<X≤100ng稀釋 2 倍5μM
5ng<X≤25ng稀釋 10 倍1μM
1ng<X≤5ng稀釋 25 倍0.4μM

2,按照下表所示各組分用量配制反應體系,并將配制完成的反應體系輕柔混勻后置于冰上

名稱體積
dA-tailed DNA40μl
Adapter -Ligation Buffer50μl*
Adapter -Ligation Enzyme5μl
DNA Adapter5μl**
Total volume100μl

注:* Adapter -Ligation Buffer 長時間放置會有白色沉淀,用前請上下顛倒、振蕩,使液體中白色沉淀充分溶 解并瞬時離心后使用。 
      **本公司接頭濃度為 10μM,請根據片段化 dsDNA 量對接頭進行稀釋,加水補齊,使接頭體積為 5μl。

3,將此配制好的 100μl連接反應液輕柔吸打混勻,置于 PCR 儀中,反應程序如下:

溫度時間
熱蓋 105℃off
16℃15min
4℃Hold

注:當片段化 dsDNA 量較低,實驗效果不理想時,可嘗試將連接時間延長一倍。

4,連接產物磁珠純化(Post Ligation Clean Up) 該步驟使用磁珠對連接產物進行純化或分選。純化可除去未連 接的 Adapter 或 Adapter Dimer 等無效產物。

連接產物磁珠純化(Post Ligation Clean Up)

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